Зоологический музей ИвГУ начал создаваться одновременно с открытием в сентябре 1975 г кафедры зоологии, которой руководил известный ученый гидробиолог, профессор Г.Л. Шкорбатов.

Коллекция музея формировалась за счет разных источников. Часть материалов была собрана студентами и преподавателями во время полевых практик и экспедиций, которые в то время проводились как на территории Ивановской области, так и других частей СССР от Дальнего Востока до Белого моря. Однако главное богатство музея было получено от ряда организаций и частных лиц. Так, зоологический музей МГУ передал большую коллекцию чучел птиц, рептилий и млекопитающих, а также витрины для их размещения. Институт биологии южных морей (г. Севастополь) подарил коллекцию морских рыб и беспозвоночных животных. Ряд экспонатов подарила кафедра зоологии беспозвоночных Ленинградского университета. Основа экспозиции тропических бабочек и моллюсков была приобретена у вдовы профессора Слонима.

В настоящее время музей располагается в 4-м учебном корпусе ИвГУ. Экспонаты занимают 2 аудитории (около 100 кв.м), а также размещены в витринах в коридорах корпуса. В музее представлено более 300 чучел и препаратов позвоночных животных, несколько тысяч экземпляров насекомых, моллюсков и других беспозвоночных животных. В экспозиции представлена часть животных, занесенных в Красные книги различных рангов. По размеру коллекции, ценности экспонатов и разнообразию представленных видов зоологический музей ИвГУ не имеет равных в Верхне-Волжском регионе и ближайших к нему областях.

Ежегодно музей посещают более 2000 человек, в основном школьников и студентов. Материалы музея используются для занятий со студентами и научно-исследовательских работ. Экспонаты периодически предоставляются другим музеям г. Иваново и области для организации выставок. Музей постоянно участвует в проведении Олимпиад по биологии разных уровней.

Зоологический музей ИвГУ является членом Ассоциации естественноисторических музеев России и участвует в конференциях, проводимых ассоциацией. Последняя конференция была в октябре 2000 г в Дарвиновском музее (г.Москва).

С 1999 г музеем заведует А.А. Майоров. Музей работает в тесном контакте с кафедрой зоологии Ивановского университета (заведующий кафедрой, профессор В.А. Исаев, научный куратор - доцент А.М. Тихомиров).